La struttura di una proteina è una sola ed è quella NATIVA, che corrisponde alla sua funzione biologica.
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| parziale valenza di doppio legame |
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| dipolo elettrico |
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| strutture limite di risonanza |
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| libera rotazione a monte e a valle del legame peptidico |
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| grafico di Ramachandran |
La struttura primaria di una proteina è costituita dalla sequenza degli L-amminoacidi che la compongono.
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| legami H in un'alfa elica |
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| struttura di un'alfa elica |
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| alfa elica vista dall'alto/basso con i gr R sporgenti |
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| Pro destabilizzante |
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| Gly destabilizzante |
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| a elica della cheratina |
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| ponti S-S nella cheratina |
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| foglietto B parallelo |
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foglietto B antiparallelo
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| schematizzazione |
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| fasi della sintesi del collagene |
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| collagene |
Biosintesi del collagene:
1. Trascrizione dell'mRNA
2. Formazione del pre-pro-peptide come primo prodotto della traduzione con una sequenza segnale sull'N-terminale. Una volta che la traduzione è terminata il pre-pro-collagene entra nel RE per l'elaborazione post-traduzionale.
3. Dall'alfa peptide al procollagene
- la sequenza di riconoscimento si dissolve --> propeptide
- formazione dell'idrossiprolina e dell'idrossilisina (importanti per la formazione di legami crocaiti) grazie agli enizmi prolil-idrossilasi e lisil-idrossilasi che richiedono vit. C come cofattore. vedi SCORBUTO
4. glicosilazione (aggiunta di glucosio/galattosio) sui residui di HyLys nel Golgi. A questo punto i propeptidi si avvolgono in senso sinistrorso, 3 propeptidi si avvolgono su loro stessi a formare una tripla elica di procollagene.
L-Prolina + α-ketoglutarato + O2 → 4-idrossiprolina + CO2 + succinato
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| idrossilazione della Pro |
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| 5-idrossilisina (HyLys) |
4. glicosilazione (aggiunta di glucosio/galattosio) sui residui di HyLys nel Golgi. A questo punto i propeptidi si avvolgono in senso sinistrorso, 3 propeptidi si avvolgono su loro stessi a formare una tripla elica di procollagene.
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| glicosilazione dell'HyLys |
5. aggiunta di oligosaccaridi nel Golgi e formazione di vescicole di secrezione.
6. formazione del tropocollagene: una volta fuori dalla cellula vengono rimosse le estremità ridondanti del procollagene ad opera dell'enzima peptidasi.
7. formazione delle fibrille collagene: l'enzima lisina ossidasi agisce sulla Lys e l'HyLys trasformando il C epsilon in un gruppo aldeidico (allisina) che può formare legami covalenti tra le molecole di tropocollagene.
Il ripiegamento di una proteina avviene attraverso una serie di stadi intermedi secondo un meccanismo cooperaitvo gerarchico.
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| formazione di legami crociati |
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| allisina |
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| formazione della deidroidrossilisinonorleucina |
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| formazione della base di Shiff |
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| striature periodiche del collagene |
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| strutture delle proteine |
Il ripiegamento di una proteina avviene attraverso una serie di stadi intermedi secondo un meccanismo cooperaitvo gerarchico.
Con il procedere del processo di formazione di interazioni diminuisce il numero di conformazioni ammesse.
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| imbuto di ripiegamento |
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